Eines Morgens wacht Alex auf und kann sich an nichts mehr erinnern, aber er verfügt plötzlich über übersinnliche Kräfte.
Diese verdankt er einem Virus, welcher ganz New York in einen Ausnahmezustand versetzt. Alex wird von den Militärs und riesigen Mutanten gejagt und muss seine neuen Fähigkeiten geschickt einsetzen, um den Grund für die Katastrophe ans Licht zu führen. Ab sofort ist er ungemein stark und kann sich in jeden beliebigen Körper versetzen und somit dessen Aussehen annehmen und für Verwirrung in den feindlichen Reihen sorgen.
Genausogut kann er sich euch Helikopter, Panzer oder andere Fahrzeuge schnappen. Blitzschnell kann Alex durch Straßen sprinten und sich an Wänden entlang gangeln, Fahrzeuge stehen ihm auch nicht mehr im Weg, denn diese schleudert er einfach beiseite.
In Prototype steht euch eine riesige Spielwelt zur Verfügung und lässt euch jede Menge Freiraum und genug Zerstörungsmöglichkeiten.
Das Spiel wird voraussichtlich im 3. Quartal 2008 für PC, Playstation 3 und Xbox 360 in den Handel kommen.
